Õpiobjektid -> Indiviidide vaheline aditiivgeneetiline sugulus


INDIVIIDIDE VAHELINE ADITIIVGENEETILINE SUGULUS


ÕPIOBJEKTI KIRJELDUS SUGULUS-
KOEFITSIENTIDE
OLEMUS
WRIGHT'I RAJAKOEFITSIENTIDE MEETOD HENDERSONI MEETOD TARKVARA
Pedigree Viewer
ÜLESANDED SISUKORD

SUGULUSKOEFITSIENTIDE OLEMUS -> INBRIIDINGUKOEFITSIENT

Sõltumatute sündmuste tõenäosuste lineaarkombinatsioonina avaldunud suguluskoefitsientide arvutamine muutub keerulisemaks sugulasaretuse korral. Viimane tähendab omavahel suguluses olevate indiviidide ristamist, toob kaasa homosügootsuse suurenemise ja tingib selle, et uuritava indiviidi samas lookuses paiknevate alleelide Ai ja Aj päritolult identsuse tõenäosus ei pruugi enam võrduda nulliga, .

Sugulasaretuse osa indiviidi X genotüübis peegeldab inbriidingukoefitsient FX, mis on defineeritud kui tõenäosus, et indiviidi juhuslikult valitud lookuses paiknevad alleelid Ai ja Aj on identsed päritolult:

.


Uurime järgnevalt näiteks, kuidas muutub vanema ja järglase vaheline sugulus, kui vanema inbriidingukoefitsient on nullist suurem.

Võtame vaatluse alla vanema X, alleelidega uuritavas lookuses Ai ja Aj, ning järglase O, alleelidega uuritavas lookuses Ak ja Al.

On selge, et üks alleelidest Ak või Al peab olema identne kas alleeliga Ai või alleeliga Aj. Eeldades, et vanemindiviidi alleelid Ai ja Aj on erinevad, avaldub vanema ning järglase vaheline Malécot'i suguluskoefitsient vastavalt valemile (1) kujul:

.
(3)

sest murru lugejas olevaist tõenäosustest saab vaid üks olla võrdne 1-ga ning kõik ülejäänud kolm võrduvad 0-ga.

Samas on siiski võimalik, et

.
(4)

st, et indiviidi X emal ja isal on ühine eellane, kelle sama alleeli koopiad võivad olla nii alleel Ai kui ka alleel Ai.

Oletame konkreetsuse mõttes, et järglasele on vanemalt pärandunud alleel Ai nii, et . Tänu seosele (4) kehtib siis ka seos , mistõttu on vanema ja järglase vahelise suguluskoefitsiendi arvutamise valem (3), arvestades vanema võimalikku inbriidingut, ümber kirjutatav kujul

.

Analoogse tulemuse saame ka, eeldades alleeli Ak asemel alleeli Al pärandumist.

Vanema ja järglase vaheline aditiivgeneetiline sugulus on tänu seosele (2) leitav valemist

.

[¤] Sissejuhatus

[¤] Malécot'i suguluskoefitsient

[¤] Wright'i suguluskoefitsient

[¤] Inbriidingukoefitsient