|
Kreutzwaldi 62, A-213
![](http://ph.emu.ee/~ktanel/email.gif)
|
|
Loengukursused -> Loomade aretusväärtuse hindamine ja aretusprogrammid
Loomade aretusväärtuse hindamine ja aretusprogrammid
[Estimation of breeding value and breeding programmes]
(VL.0192; 7 EAP; kevadsemester
2012; E)
EMÜ VLI loomakasvatuse magistrantidele
|
|
|
-
Aeg, koht:
2.02.2012, 915-12; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Sissejuhatus ainesse - aretusprogramm,
aretusväärtus. Sissejuhatus maatriksalgebrasse - maatriksite
olemus, tüübid, põhitehted.
Loengumaterjal:
pt1_2012.pdf (tärnita punktid).
-
Aeg, koht:
3.02.2012, 915-12; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Sissejuhatus maatriksalgebrasse - maatriksite
olemus, tüübid, põhitehted; maatriksoperatsioonid MS Excelis.
Loengumaterjal:
pt1_2012.pdf (tärnita punktid).
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
lõpus.
-
Aeg, koht:
9.02.2012, 915-12; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Sissejuhatus maatriksalgebrasse - maatriksite
olemus, tüübid, põhitehted; maatriksoperatsioonid MS Excelis.
Loengumaterjal:
pt1_2012.pdf (tärnita punktid).
Praktikumiülesanded:
pt1_2012_prax.pdf (vastuste ja lahenduste õigsust saate soovi korral kontrollida
loengumaterjali lõpust).
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
lõpus.
-
Aeg, koht:
10.02.2012, 915-12; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Tõenäosusteooria ja matemaatiline
statistika, teoreetilised jaotused, parameetrite hindamine.
Loengumaterjal:
pt2_2012.pdf .
-
Aeg, koht:
16.02.2012, 915-12; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Tõenäosusteooria ja matemaatiline
statistika, teoreetilised jaotused, parameetrite hindamine.
Loengumaterjal:
pt2_2012.pdf .
Praktikumiülesanded: pt 2.5 loengumaterjali
lõpus.
-
Aeg, koht:
17.02.2012, 915-12; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Indiviididevaheline sugulus – suguluskoefitsiendid,
inbriidingukoefitsient, Wright'i ja Hendersoni meetodid nende
leidmiseks.
Loengumaterjal:
pt3_2012.pdf .
-
Aeg, koht:
23.02.2012, 915-12; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Indiviididevaheline sugulus – suguluskoefitsiendid,
inbriidingukoefitsient, Wright'i ja Hendersoni meetodid nende
leidmiseks.
Loengumaterjal:
pt3_2012.pdf .
-
Aeg, koht:
24.02.2012. Auditoorset õppetööd ei toimu.
Sisu: Triigi
kodus lipp ära
ja mine suusatama (26.02.2012 toimub järjekordne Maaülikooli
maraton :).
-
Aeg, koht:
1.03.2012, 915-12; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Indiviididevaheline sugulus – suguluskoefitsiendid,
inbriidingukoefitsient, Wright'i ja Hendersoni meetodid nende
leidmiseks.
Loengumaterjal:
pt3_2012.pdf .
Praktikumiülesanded:
pt3_2012_prax.pdf .
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
lõpus.
-
Aeg, koht:
2.03.2012, 915-12; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Põlvnemisandmed ja nende haldamine,
sugulus- ja inbriidingukoefitsiendid.
Loengumaterjal:
pt3_2012.pdf .
Praktikumiülesanded:
pt3_2012_prax.pdf .
Tarkvara: "Pedigree Viewer" --
http://www-personal.une.edu.au/~bkinghor/pedigree.htm
Andmed:
pjetraan.ped ,
p00_12pk.ped ,
eesti_hobused.txt .
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
lõpus.
-
Aeg, koht:
8.03.2012, 915-12; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Põlvnemisandmed ja nende haldamine,
sugulus- ja inbriidingukoefitsiendid.
Loengumaterjal:
pt3_2012.pdf .
Praktikumiülesanded:
pt3_2012_prax.pdf .
Tarkvara: "Pedigree Viewer" --
http://www-personal.une.edu.au/~bkinghor/pedigree.htm
Andmed:
pjetraan.ped ,
p00_12pk.ped ,
eesti_hobused.txt .
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
lõpus.
-
Aeg, koht:
9.03.2012, 915-12; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Meeldetuletus populatsioonigeneetikast
ja aretusteooriast – geneetiline mudel, geneetiline väärtus
versus aretusväärtus, päritavus, geneetiline
korrelatsioon, korduvus.
Loengumaterjal:
pt4_2012.pdf .
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
lõpus.
-
Aeg, koht:
15.03.2012, 915-12; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Meeldetuletus populatsioonigeneetikast
ja aretusteooriast – geneetiline mudel, geneetiline väärtus
versus aretusväärtus, päritavus, geneetiline
korrelatsioon, korduvus.
Loengumaterjal:
pt4_2012.pdf .
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
lõpus.
-
Aeg, koht:
16.03.2012, 915-12; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Selektsiooniindeksid.
Loengumaterjal:
pt5_2012.pdf .
Teisipäeval,
20. märtsil kell 12.00 (Kreutzwaldi 62, ruum A-201) kaitseb
Sirje Värv väitekirja “Eesti piimaveisetõugude iseloomustamine
geneetiliste markerite alusel” filosoofiadoktori kraadi taotlemiseks
loomakasvatuse erialal.
Tegemist on esmakordse kompleksse uuringuga Eestis, kus Eesti
tõuge on iseloomustatud samade biokeemiliste ja molekulaargeneetiliste
markerite alusel ning võrreldud teiste Põhja-Euroopa
ja Balti riikide tõugudega, et selgitada meie veisetõugude
päritolu, sugulust ja geneetilist unikaalsust.
Doktoritöö oponendiks on dr Johannes Arjen Lenstra Utrechti
Ülikoolist, kes on ülemaailmselt tunnustatud veiste
ja lammaste diversiteediuurija.
Kolmapäeval,
21. märtsil kell 10.15 toimub dr Lenstra loeng teemal
Genome-wide analysis of the genetic diversity of sheep breeds
around the world: history, conservation and selection.
Loeng toimub aadressil Kreutzwaldi 62, ruumis A-209.
Dr Lenstra tutvustab esimese lammaste ülegenoomse uuringu
käigus saadud tulemusi, mis publitseeriti 7. veebruaril 2012.
Artikliga saab tutvuda lingilt http://www.plosbiology.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pbio.1001258
-
Aeg, koht:
22.03.2012, 915-12; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Selektsiooniindeksid.
Loengumaterjal:
pt5_2012.pdf .
Praktikumiülesanded: loengumaterjali lõpus.
Tarkvara:
stselind_est.xls
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
lõpus.
-
Aeg, koht:
23.03.2012, 915-12; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Selektsiooniindeksid.
Loengumaterjal:
pt5_2012.pdf .
Praktikumiülesanded: loengumaterjali lõpus.
Tarkvara:
stselind_est.xls
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
lõpus, andmed Exceli tabelina on salvestavad siit:
hobu_index.xls .
29.03.2012
ja 30.03.2012 auditoorset õppetööd ei toimu!![](terve_loom_2012.jpg)
Loengute asemel
külastage konverentsi "Terve loom ja tervislik toit
2012" EMÜ peahoones Kreutzwaldi 1a.
Konverentsi
kava
Registreerimine
(kuni 20.03.2012)
(tasuta; samas, ega keegi ka registreerimata kuulajaid välja
ei viska)
-
Aeg, koht:
5.04.2012, 1015-12; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Selektsiooniindeksid / Sissejuhatus üldiste
lineaarsete mudelite teooriasse.
Loengumaterjal:
pt5_2012.pdf , pt6_2012.pdf.
Praktikumiülesanded: loengumaterjali lõpus.
Tarkvara:
stselind_est.xls
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
lõpus, andmed Exceli tabelina on salvestavad siit:
hobu_index.xls .
![](munapyhad.jpg)
-
Aeg, koht:
12.04.2012, 1015-12; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Sissejuhatus lineaarsete mudelite teooriasse
regressioon-, dispersioon- ja kovariatsioonanalüüsi
mudelid. Üldise lineaarse mudeli esitused objektiviisi
ja maatrikskujul, plaanimaatriksid.
Loengumaterjal:
pt6_2012.pdf .
Praktikumi materjal ja ülesanded:
lahendada Excelis läbi loengu näiteandmestik;
- salvesta arvutisse andmestik:
GLM_naide_2012k.xls ;
- konstrueeri täisastakuga mudelile vastav plaanimaatriks
X, käsitledes kõiki faktoreid
fikseeritutena.
-
Aeg, koht: 13.04.2012, 915-12;
Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: ÜLM
parameetrite hindamine – reparametriseerimine, fikseeritud
efektide ja vähimruutkeskmiste
hindamine (BLUE).
Loengumaterjal:
pt6_2012.pdf .
Praktikumi materjal ja ülesanded: jätkub
eelmisel korral alustatud ülesande lahendamine:
- salvesta arvutisse andmestik:
GLM_naide_2012k.xls ;
- konstrueeri täisastakuga mudelile vastav plaanimaatriks
X, käsitledes kõiki faktoreid
fikseeritutena;
- leia vähimruutude hinnangud mudeli parameetritele
(b = (XTX)-1XTy
) ja tee omale selgeks nende tähendus;
- leia diskreetsete faktorite ('sugu', 'isa' ja 'psk suurus')
vähimruutkeskmised, võrdle neid tavaliste aritmeetiliste
keskmistega (vt ka näidete lahendust/kommentaare loengumaterjalides).
-
Aeg, koht: 19.04.2012, 1015-12;
Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: ÜLM
parameetrite hindamine – BLUE ja BLUP, Hendersoni segamudeli
võrrand fikseeritud ja juhuslike efektide samaaegseks
hindamiseks.
Loengumaterjal:
pt6_2012.pdf .
Praktikumi materjal ja ülesanded: jätkub
varemalt alustatud ülesande lahendamine, andmestik
GLM_naide_2012k.xls :
- konstrueeri täisastakuga mudelile vastavad plaanimaatriksid
X ja Z käsitledes isa
juhusliku faktorina ja ülejäänud faktoreid
fikseeritutena;
- võta päritavuseks h2=0,2 ja leia
viimase mudeli parameetrite hinnangud Hendersoni segamudeli
võrrandist; mida kujutavad enesest isade mõjude
hinnangud?
-
Aeg, koht:
20.04.2012, 915-12; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Üldine lineaarne mudel.
Loengumaterjal:
pt6_2012.pdf .
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
lõpus, andmestik iseseisva ülesande tarvis:
GLM_ise.xls .
-
Aeg, koht:
26.04.2012, 1015-12; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Aretusväärtuste hindamine isa ja looma
mudelist.
Loengumaterjal:
pt71_2010.pdf .
Tarkvara:
SAMod_1c.xls
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
lõpus.
-
Aeg, koht:
27.04.2012, 915-12; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Aretusväärtuste hindamine isa ja looma
mudelist.
Loengumaterjal:
pt71_2010.pdf .
Tarkvara:
SAMod_1c.xls
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
lõpus.
-
Aeg, koht:
4.05.2012, 915-12; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Erinevaid mudeleid loomade geneetilisel
hindamisel.
Loengumaterjal:
Kaart, T. (2001). Ülevaade
geneetiliste parameetrite hindamisel kasutatavatest mudelitest.
Rmt.: Lokk, E. (toim.). Eesti Põllumajandusülikooli
Loomakasvatusinstituudi teadustöid 71, Tartu, 52 - 66.
Kaart, T. (2011). Genoomselektsioon – kuidas ja milleks? Tõuloomakasvatus,
14(4), 18 - 20 [mitte eriti õnnestunud korrektuuri järgselt
ajakirjas ilmunud artikli asemel soovitan lugeda algset versiooni:
genoomselektsioon.pdf]
Tarkvara: VCE (http://vce.tzv.fal.de/)
Andmed ja programmid: http://www.eau.ee/~ktanel/kool_ja_too/LKI_1_2608/vce/,
http://www.eau.ee/~ktanel/VL_0192/esthobu/
-
Aeg, koht:
11.05.2012, 915-15; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Erinevate loomaliikide ja tõugude
aretusprogrammid ning reaalne aretus-säilitustegevus (Eestis).
!!!
Ettekanded !!!
Lingid: http://www.jkkeskus.ee/page.php?page=1091,
http://www.jkkeskus.ee/page.php?page=0116,
..., http://www-interbull.slu.se/national_ges_info2/framesida-ges.htm
(vt "Linkide ja kirjanduse"
lehte).
-
Aeg, koht:
17.05.2012, 1015-12; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Erinevate loomaliikide ja tõugude
aretus-säilitusprogrammid ja reaalne aretus-säilitustegevus
Eestis.
Lingid:
http://www.jkkeskus.ee/page.php?page=1091,
http://www.jkkeskus.ee/page.php?page=0116,
..., http://www-interbull.slu.se/national_ges_info2/framesida-ges.htm
(vt "Linkide ja kirjanduse"
lehte).
-
Aeg, koht:
18.05.2012, 1015-12; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Viimane loeng.
Veel juttu erinevate loomaliiikide aretusprogrammidest (sead,
veised). Kokkuvõtted. Juttu eksamist.
-
NB!
Iseseisvate ülesannete esitamise tähtaeg:
esmaspäev, 21.05.2012
(kõik kodused ülesanded ühe dokumendina: ylesanded_2012.pdf).
-
Eksam: reede, 25.05.2012, kell 10 (Kr. 62, B-213).
|
|