|
Kreutzwaldi 62, A-213
![](http://ph.emu.ee/~ktanel/email.gif)
|
|
Loengukursused -> Loomade aretusväärtuse hindamine ja aretusprogrammid
Loomade aretusväärtuse hindamine ja aretusprogrammid
[Estimation of breeding value and breeding programmes]
(VL.0192; 7 EAP; kevadsemester
2017; E)
EMÜ VLI loomakasvatuse magistrantidele
|
|
|
-
Aeg, koht:
1.02.2017, 815-10 ja 1215-16; Kreutzwaldi
62, B-213.
Sisu: Sissejuhatus ainesse - aretusprogramm,
aretusväärtus. Sissejuhatus maatriksalgebrasse - maatriksite
olemus, tüübid, põhitehted; maatriksoperatsioonid MS Excelis.
Loengumaterjal:
pt1.pdf (tärnita punktid).
-
Aeg, koht:
8.02.2017, 815-10 ja 1215-16; Kreutzwaldi
62, B-213.
Sisu: Sissejuhatus maatriksalgebrasse - maatriksite
olemus, tüübid, põhitehted; maatriksoperatsioonid MS Excelis.
Loengumaterjal:
pt1.pdf (tärnita punktid).
Praktikumiülesanded: pt_124_naide.xlsx;
pt1_prax.pdf (vastuste ja lahenduste õigsust saate soovi korral kontrollida
loengumaterjali lõpust).
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
lõpus.
-
Aeg, koht:
15.02.2017, 815-10 ja 1215-16; Kreutzwaldi
62, B-213.
Sisu: Sissejuhatus tõenäosusteooriasse
+ rakendused geneetikas.
Loengumaterjal:
pt2.pdf .
Praktikumiülesanded: ülesanne 1 peatükis
2.5 loengumaterjali lõpus.
- Aeg, koht: 22.02.2017,
815-10 ja 1215-16; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Sissejuhatus matemaatilisse statistikasse,
teoreetilised jaotused, parameetrite hindamine + rakendused aretuses.
Loengumaterjal:
pt2.pdf .
Praktikumiülesanded: ülesanne 2 peatükis
2.5 loengumaterjali lõpus.
- Aeg, koht: 1.03.2017.
Auditoorset
õppetööd ei toimu!
Sisu: Loengute asemel külastage konverentsi
"Terve loom ja tervislik toit 2017" EMÜ peahoones
Kreutzwaldi 1a.
![](terve_loom_2017.jpg)
Konverentsi
koduleht
Registreerimine
(tasuta; samas, ega keegi ka registreerimata kuulajaid välja
ei viska)
-
Aeg, koht:
8.03.2017, 815-10 ja 1215-16; Kreutzwaldi
62, B-213.
Sisu: Indiviididevaheline sugulus – suguluskoefitsiendid,
inbriidingukoefitsient, Wright'i ja Hendersoni meetodid nende
leidmiseks.
Loengumaterjal:
pt3.pdf .
Praktikumiülesanded:
pt3_prax.pdf .
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
lõpus.
-
Aeg, koht:
15.03.2017, 815-10 ja 1215-16; Kreutzwaldi
62, B-213.
Sisu: Põlvnemisandmed ja nende haldamine,
sugulus- ja inbriidingukoefitsiendid.
Loengumaterjal:
pt3.pdf .
Praktikumiülesanded:
pt3_prax.pdf .
Tarkvara: "Pedigree Viewer" --
http://www-personal.une.edu.au/~bkinghor/pedigree.htm
Andmed:
pjetraan.ped ,
p00_12pk.ped ,
eesti_hobused.txt .
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
lõpus.
-
Aeg, koht:
22.03.2017, 815-10 ja 1215-16; Kreutzwaldi
62, B-213.
Sisu: Meeldetuletus populatsioonigeneetikast
ja aretusteooriast – geneetiline mudel, aretusväärtus,
populatsiooni geneetilised parameetrid; selektsiooniteooria.
Loengumaterjal:
pt4_2012.pdf .
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
lõpus.
-
Aeg, koht:
29.04.2017, 815-10 ja 1215-16; Kreutzwaldi
62, B-213.
Sisu: Selektsiooniindeksid.
Loengumaterjal:
pt5.pdf .
Praktikumiülesanded: loengumaterjali lõpus.
Tarkvara:
stselind_est.xls
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
lõpus, andmed Exceli tabelina on salvestatavad siit:
hobu_index.xls .
-
Aeg, koht:
5.04.2017, 815-10 ja 1215-16; Kreutzwaldi
62, B-213. (NB! Pärastlõunasel ajal kell
1215-16 auditoorset
õppetööd ei toimu, lahendage ise praktikumi
ja ka koduseid ülesandeid.)
Sisu: Selektsiooniindeksid.
Loengumaterjal:
pt5.pdf .
Praktikumiülesanded: loengumaterjali lõpus.
Tarkvara:
stselind_est.xls
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
lõpus, andmed Exceli tabelina on salvestatavad siit:
hobu_index.xls .
-
Aeg, koht:
12.04.2017, 815-10 ja 1215-16; Kreutzwaldi
62, B-213.
Sisu: Selektsiooniindeksite puudused ja nende
ületamine üldiste lineaarsete mudelite abil. Sissejuhatus
lineaarsete mudelite teooriasse regressioon-, dispersioon-
ja kovariatsioonanalüüsi mudelid. Üldise lineaarse
mudeli esitused objektiviisi ja maatrikskujul, plaanimaatriksid.
Loengumaterjal:
pt5.pdf .
-
Aeg, koht:
19.04.2017, 915-15; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Sissejuhatus lineaarsete mudelite teooriasse.
Üldise lineaarse mudeli parameetrite
hindamine – reparametriseerimine, BLUE
ja BLUP, vähimruutkeskmised, Hendersoni segamudeli võrrand
fikseeritud ja juhuslike efektide samaaegseks hindamiseks.
Aretusväärtuste hindamine isa mudelist.
Loengumaterjal:
pt6_2012.pdf .
Praktikumi materjal ja ülesanded:
lahendage Excelis läbi loengu näiteandmestik:
- salvestage arvutisse andmestik:
GLM_naide_2012k.xls ;
- konstrueerige täisastakuga mudelile vastav plaanimaatriks
X, käsitledes kõiki faktoreid
fikseeritutena;
- leidke vähimruutude hinnangud mudeli parameetritele
(b = (XTX)-1XTy
) ja tehke omale selgeks nende tähendus;
- leidke diskreetsete faktorite ('sugu', 'isa' ja 'psk suurus')
vähimruutkeskmised, võrrelge neid tavaliste aritmeetiliste
keskmistega (vt ka näidete lahendust/kommentaare loengumaterjalides);
- konstrueerige
täisastakuga mudelile vastavad plaanimaatriksid X
ja Z käsitledes isa juhusliku faktorina
ja ülejäänud faktoreid fikseeritutena;
- leidke
viimase mudeli parameetrite hinnangud Hendersoni segamudeli
võrrandist (võttes päritavuseks h2=0,2);
mida kujutavad enesest isade mõjude hinnangud?
Iseseisvad ülesanded:
ülesanded loengumaterjali lõpus.
-
Aeg,
koht: teisipäev, 25.04.2017,
Kreutzwaldi 62, B-201
- 12-14
"Farm animal genetic resources management in the UK"
Prof. emer. Stephen Hall
- 14-15
"Poznan University and animal production in Poland"
Prof. Tomasz Szwaczkowski
- 15-17
"Conservation of animal genetic resources"
Prof. Tomasz Szwaczkowski
kolmapäev,
26.04.2017 Prof.
Tomasz Szwaczkowski (Department
of Genetics and Animal Breeding, Poznan University of Life Sciences)
loengud
kell 9-12,
Kreutzwaldi 62, A-209
- 9-11 "Statistical
modelling of livestock data"
- 11-12 "Animal
breeding in zoological gardens"
kell 13-15,
Kreutzwaldi 62, B-132
- 13-14 "Genetic
aspects of feed efficiency in poultry"
- 14-15 "Globalisation
of animal breeding"
- Aeg,
koht: 3.05.2017, 915-15;
Kreutzwaldi
62, B-213.
Sisu: Aretusväärtuste hindamine isa ja looma
mudelist.
Loengumaterjal:
pt71_2010.pdf .
Tarkvara:
SAMod_1c.xls .
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
lõpus.
- Aeg,
koht: 10.05.2017,
915-15; Kr.
62, B-213.
Sisu: Emapoolse efektiga mudelid. Juhuslike regressioonikordajatega
mudelid. Marker- ja genoomselektsioon.
Loengumaterjal:
Kaart, T. (2001). Ülevaade
geneetiliste parameetrite hindamisel kasutatavatest mudelitest.
Rmt.: Lokk, E. (toim.). Eesti Põllumajandusülikooli
Loomakasvatusinstituudi teadustöid 71, Tartu, 52 - 66.
Kaart, T. (2011). Genoomselektsioon – kuidas ja milleks? Tõuloomakasvatus,
14(4), 18 - 20 [mitte eriti õnnestunud korrektuuri järgselt
ajakirjas ilmunud artikli asemel soovitan lugeda algset versiooni:
genoomselektsioon.pdf]
Tarkvara: VCE (http://vce.tzv.fal.de/)
Andmed ja programmid: http://www.eau.ee/~ktanel/VL_0192/esthobu/
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
pt71_2010.pdf lõpus.
- Aeg,
koht: 17.05.2017,
915-15; Kreutzwaldi
62, B-213.
Sisu: Erinevate loomaliikide ja tõugude
aretusprogrammid ning reaalne aretus-säilitustegevus (Eestis).
!!!
Ettekanded !!!
|
|
|