Aeg, koht: 5.02.2014, 10¹⁵-14; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Sissejuhatus ainesse - aretusprogramm, aretusväärtus. Sissejuhatus maatriksalgebrasse - maatriksite olemus, tüübid, põhitehted; maatriksoperatsioonid MS Excelis.
Loengumaterjal: pt1.pdf (tärnita punktid).
 

Aeg, koht: 6.02.2014, 12¹⁵-14; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Sissejuhatus maatriksalgebrasse - maatriksite olemus, tüübid, põhitehted; maatriksoperatsioonid MS Excelis.
Loengumaterjal: pt1.pdf (tärnita punktid).
 

Aeg, koht: 7.02.2014, 12¹⁵-14; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Sissejuhatus maatriksalgebrasse - maatriksite olemus, tüübid, põhitehted; maatriksoperatsioonid MS Excelis.
Loengumaterjal: pt1.pdf (tärnita punktid).
Praktikumiülesanded: pt_124_naide.xlsx; pt1_prax.pdf (vastuste ja lahenduste õigsust saate soovi korral kontrollida loengumaterjali lõpust).
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali lõpus.
 

Aeg, koht: 12.02.2014, 10¹⁵-14; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Maatriksoperatsioonid MS Excelis. Tõenäosusteooria ja matemaatiline statistika, teoreetilised jaotused, parameetrite hindamine.
Loengumaterjal: pt1.pdf (tärnita punktid), pt2.pdf .
Praktikumiülesanded: pt1_prax.pdf , pt 2.5 loengumaterjali lõpus.
 

Aeg, koht: 26.02.2014, 10¹⁵-14; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Indiviididevaheline sugulus – suguluskoefitsiendid, inbriidingukoefitsient, Wright'i ja Hendersoni meetodid nende leidmiseks.
Loengumaterjal: pt3.pdf .
Praktikumiülesanded: pt3_prax.pdf .
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali lõpus.
 

Aeg, koht: 5.03.2014, 10¹⁵-14; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Põlvnemisandmed ja nende haldamine, sugulus- ja inbriidingukoefitsiendid.
Loengumaterjal: pt3.pdf .
Praktikumiülesanded: pt3_prax.pdf .
Tarkvara: "Pedigree Viewer" -- http://www-personal.une.edu.au/~bkinghor/pedigree.htm
Andmed: pjetraan.ped , p00_12pk.ped , eesti_hobused.txt .
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali lõpus.
 

Aeg, koht: 7.03.2014, 12¹⁵-14; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Põlvnemisandmed ja nende haldamine, sugulus- ja inbriidingukoefitsiendid.
Loengumaterjal: pt3.pdf .
Praktikumiülesanded: pt3_prax.pdf .
Tarkvara: "Pedigree Viewer" -- http://www-personal.une.edu.au/~bkinghor/pedigree.htm
Andmed: pjetraan.ped , p00_12pk.ped , eesti_hobused.txt .
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali lõpus.
 

Aeg, koht: 12.03.2014.

 

Aeg, koht: 19.03.2014, 10¹⁵-14; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Põlvnemisandmed ja nende haldamine, sugulus- ja inbriidingukoefitsiendid. Meeldetuletus populatsioonigeneetikast ja aretusteooriast – geneetiline mudel, aretusväärtus.
Loengumaterjal: pt3.pdf , pt4_2012.pdf .
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali lõpus.
 

Aeg, koht: 21.03.2014, 12¹⁵-14; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Meeldetuletus populatsioonigeneetikast ja aretusteooriast – geneetiline mudel, geneetiline väärtus versus aretusväärtus, päritavus, geneetiline korrelatsioon, korduvus.
Loengumaterjal: pt4_2012.pdf .
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali lõpus.
 

Aeg, koht: 26.03.2014, 10¹⁵-14; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Meeldetuletus populatsioonigeneetikast ja aretusteooriast – geneetiline mudel, geneetiline väärtus versus aretusväärtus, päritavus, geneetiline korrelatsioon, korduvus. Selektsiooniindeksid.
Loengumaterjal: pt4_2012.pdf, pt5.pdf.
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali lõpus.
 

Aeg, koht: 2.04.2014, 10¹⁵-14; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Selektsiooniindeksid.
Loengumaterjal: pt5.pdf .
 

Aeg, koht: 4.04.2014; 12¹⁵-14; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Selektsiooniindeksid.
Loengumaterjal: pt5.pdf .
Praktikumiülesanded: loengumaterjali lõpus.
Tarkvara: stselind_est.xls
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali lõpus, andmed Exceli tabelina on salvestavad siit: hobu_index.xls .
 

Aeg, koht: 9.04.2014, 10¹⁵-14; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Sissejuhatus lineaarsete mudelite teooriasse – regressioon-, dispersioon- ja kovariatsioonanalüüsi mudelid. Üldise lineaarse mudeli esitused objektiviisi ja maatrikskujul, plaanimaatriksid. ÜLM parameetrite hindamine – reparametriseerimine, fikseeritud efektide ja vähimruutkeskmiste hindamine (BLUE).
Loengumaterjal: pt6_2012.pdf .
Praktikumi materjal ja ülesanded: lahendage Excelis läbi loengu näiteandmestik:

• salvestage arvutisse andmestik: GLM_naide_2012k.xls ;
• konstrueerige täisastakuga mudelile vastav plaanimaatriks X, käsitledes kõiki faktoreid fikseeritutena;
• leidke vähimruutude hinnangud mudeli parameetritele (b = (X^TX)^-1X^Ty ) ja tehke omale selgeks nende tähendus;
• leidke diskreetsete faktorite ('sugu', 'isa' ja 'psk suurus') vähimruutkeskmised, võrrelge neid tavaliste aritmeetiliste keskmistega (vt ka näidete lahendust/kommentaare loengumaterjalides).
   

Aeg, koht: 16.04.2014, 10¹⁵-14; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: ÜLM parameetrite hindamine – BLUE ja BLUP, Hendersoni segamudeli võrrand fikseeritud ja juhuslike efektide samaaegseks hindamiseks. Aretusväärtuste hindamine isa mudelist.
Loengumaterjal: pt6_2012.pdf .
Praktikumi materjal ja ülesanded: jätkub loengu näiteülesande lahendamine, andmestik GLM_naide_2012k.xls :

• konstrueerige täisastakuga mudelile vastavad plaanimaatriksid X ja Z käsitledes isa juhusliku faktorina ja ülejäänud faktoreid fikseeritutena;
• leidke viimase mudeli parameetrite hinnangud Hendersoni segamudeli võrrandist (võttes päritavuseks h²=0,2); mida kujutavad enesest isade mõjude hinnangud?