|
Kreutzwaldi 62, A-213
![](http://ph.emu.ee/~ktanel/email.gif)
|
|
Loengukursused -> Loomade aretusväärtuse hindamine ja aretusprogrammid
Loomade aretusväärtuse hindamine ja aretusprogrammid
[Estimation of breeding value and breeding programmes]
(VL.0192; 7 EAP; kevadsemester
2011; E)
EMÜ VLI loomakasvatuse magistrantidele
|
|
|
-
Aeg, koht:
31.01.2011, 1215-15; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Sissejuhatus ainesse. Sissejuhatus maatriksalgebrasse
- maatriksite olemus, tüübid, põhitehted.
Loengumaterjal:
pt1_2011.pdf (tärnita punktid).
-
Aeg, koht:
2.02.2011, 1215-15; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Sissejuhatus maatriksalgebrasse - maatriksite
olemus, tüübid, põhitehted; maatriksoperatsioonid MS Excelis.
Loengumaterjal:
pt1_2011.pdf (tärnita punktid).
Iseseisvad ülesanded: tärnita ülesanded loengumaterjali
lõpus.
-
Aeg, koht:
7.02.2011, 1215-15; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Sissejuhatus maatriksalgebrasse - maatriksite
olemus, tüübid, põhitehted; maatriksoperatsioonid MS Excelis.
Loengumaterjal:
pt1_2011.pdf (tärnita punktid).
Praktikumiülesanded:
pt1_2011_prax.pdf .
Iseseisvad ülesanded: tärnita ülesanded loengumaterjali
lõpus.
-
Aeg, koht:
9.02.2011, 1215-15; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Matemaatiline statistika, teoreetilised
jaotused, parameetrite hindamine.
Loengumaterjal:
pt2_2011.pdf .
-
Aeg, koht:
14.02.2011, 1215-15; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Meeldetuletus populatsioonigeneetikast
ja aretusteooriast – geneetiline mudel, geneetiline väärtus
versus aretusväärtus, päritavus, geneetiline
korrelatsioon, korduvus.
Loengumaterjal:
pt3_2011.pdf .
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
lõpus.
-
Aeg, koht:
16.02.2011, 1215-15; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Meeldetuletus populatsioonigeneetikast
ja aretusteooriast – geneetiline mudel, geneetiline väärtus
versus aretusväärtus, päritavus, geneetiline
korrelatsioon, korduvus.
Loengumaterjal:
pt3_2011.pdf .
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
lõpus.
-
Aeg, koht:
21.02.2011, 1215-15; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Indiviididevaheline sugulus – suguluskoefitsiendid,
inbriidingukoefitsient, Wright'i ja Hendersoni meetodid nende
leidmiseks.
Loengumaterjal:
pt4_2011.pdf .
-
Aeg, koht:
23.02.2011. Auditoorset õppetööd ei toimu.
Sisu: Triigi
kodus lipp ära
ja mine suusatama ![](oslo2011.jpg)
-
Aeg, koht:
28.02.2011, 1215-15; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Indiviididevaheline sugulus – suguluskoefitsiendid,
inbriidingukoefitsient, Wright'i ja Hendersoni meetodid nende
leidmiseks.
Loengumaterjal:
pt4_2011.pdf .
-
Aeg, koht:
02.03.2011, 1215-15; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Indiviididevaheline sugulus – suguluskoefitsiendid,
inbriidingukoefitsient, Wright'i ja Hendersoni meetodid nende
leidmiseks.
Loengumaterjal:
pt4_2011.pdf .
-
Aeg, koht:
07.03.2011, 1215-15; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Põlvnemisandmed ja nende haldamine,
sugulus- ja inbriidingukoefitsiendid.
Loengumaterjal:
pt4_2011.pdf .
Praktikumiülesanded:
pt4_2011_prax.pdf .
Tarkvara: "Pedigree Viewer" --
http://www-personal.une.edu.au/~bkinghor/pedigree.htm
Andmed:
pjetraan.ped ,
p00_12pk.ped ,
eesti_hobused.txt .
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
lõpus.
-
Aeg, koht:
09.03.2011, 1215-15; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Põlvnemisandmed ja nende haldamine,
sugulus- ja inbriidingukoefitsiendid.
Loengumaterjal:
pt4_2011.pdf .
Praktikumiülesanded:
pt4_2011_prax.pdf .
Tarkvara: "Pedigree Viewer" --
http://www-personal.une.edu.au/~bkinghor/pedigree.htm
Andmed:
pjetraan.ped ,
p00_12pk.ped ,
eesti_hobused.txt .
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
lõpus.
-
Aeg, koht:
16.03.2011. Klassis
teostatavate ehitustööde tõttu auditoorset
õppetööd ei toimu. ![](site_under_constr_v.gif)
Sisu: Lahendage
ära eelmiste peatükkide iseseisvad ülesanded.
- Aeg, koht: 17.03.2011.
Klassis
teostatavate ehitustööde tõttu auditoorset
õppetööd ei toimu.
![](site_under_constr_v.gif)
Sisu: Lahendage
ära eelmiste peatükkide iseseisvad ülesanded.
-
Aeg, koht:
23.03.2011, 1215-15; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Põlvnemisandmed ja nende haldamine,
sugulus- ja inbriidingukoefitsiendid. / Selektsiooniindeksid.
Loengumaterjal:
pt4_2011.pdf ,
pt5_2011.pdf .
Praktikumiülesanded:
pt4_2011_prax.pdf .
Tarkvara: "Pedigree Viewer" --
http://www-personal.une.edu.au/~bkinghor/pedigree.htm
Andmed:
pjetraan.ped ,
p00_12pk.ped ,
eesti_hobused.txt .
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
lõpus.
-
Aeg, koht:
24.03.2011, 915-12; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Selektsiooniindeksid.
Loengumaterjal:
pt5_2011.pdf .
Praktikumiülesanded:
pt5
_2011_prax.pdf .
Tarkvara:
stselind_est.xls
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
lõpus.
-
Aeg, koht:
30.03.2011, 1215-15; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Selektsiooniindeksid.
Loengumaterjal:
pt5_2011.pdf .
Praktikumiülesanded:
pt5_2011_prax.pdf .
Tarkvara:
stselind_est.xls
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
lõpus, andmed Exceli tabelina on salvestavad siit:
hobu_index.xls .
-
Aeg, koht:
31.03.2011, 915-12; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Selektsiooniindeksid. / Sissejuhatus
lineaarsete mudelite teooriasse.
Loengumaterjal:
pt5_2011.pdf ,
pt6_2010.pdf .
Praktikumiülesanded:
pt5_2011_prax.pdf .
Tarkvara:
stselind_est.xls
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
lõpus, andmed Exceli tabelina on salvestavad siit:
hobu_index.xls .
-
Aeg, koht: 06.04.2011, 1215-15;
Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Sissejuhatus
lineaarsete mudelite teooriasse regressioon-, dispersioon-
ja kovariatsioonanalüüsi mudelid. Üldise lineaarse
mudeli esitused objektiviisi ja maatrikskujul, plaanimaatriksid.
Loengumaterjal:
pt6_2010.pdf .
Praktikumi materjal ja ülesanded: lahendada
Excelis läbi loengu näiteandmestik;
- salvesta arvutisse andmestik:
GLM_naide.xls ;
- konstrueeri täisastakuga mudelile vastav plaanimaatriks
X (pt 6.5.3 loengumaterjalides) käsitledes
kõiki faktoreid fikseeritutena ja ema vanust diskreetsena.
-
Aeg, koht: 07.04.2011, 915-12;
Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: ÜLM
parameetrite hindamine – reparametriseerimine, fikseeritud
efektide ja vähimruutkeskmiste
hindamine (BLUE).
Loengumaterjal:
pt6_2010.pdf .
Praktikumi materjal ja ülesanded: jätkub
eelmisel korral alustatud ülesande lahendamine:
- salvesta arvutisse andmestik:
GLM_naide.xls ;
- konstrueeri täisastakuga mudelile vastav plaanimaatriks
X (pt 6.5.3 loengumaterjalides) käsitledes
kõiki faktoreid fikseeritutena ja ema vanust diskreetsena;
- leia vähimruutude hinnangud mudeli parameetritele
(valem 6.13 – b = (XTX)-1XTy
) ja tee omale selgeks nende tähendus (vt ka näite
lahendust/kommentaare loengumaterjalides).
-
Aeg, koht: 13.04.2011, 1215-15;
Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Üldine lineaarne mudel.
Sisu: ÜLM
parameetrite hindamine – BLUE ja vähimruutkeskmised.
Loengumaterjal:
pt6_2010.pdf .
Praktikumi materjal ja ülesanded: jätkub
eelmisel nädalal alustatud ülesande lahendamine, andmestik
GLM_naide.xls :
- konstrueeri täisastakuga mudelile vastav plaanimaatriks
X käsitledes kõiki faktoreid
fikseeritutena ja ema vanus jäta mudelist välja;
- leia vähimruutude hinnangud mudeli parameetritele
ja diskreetsete faktorite ('sugu', 'isa' ja 'psk suurus')
vähimruutkeskmised, võrdle viimaseid tavaliste
aritmeetiliste keskmistega (vt ka näidete lahendust/kommentaare
loengumaterjalides, pt 6.6.3);
-
Aeg, koht: 14.04.2011, 915-12;
Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: ÜLM
parameetrite hindamine – BLUE ja BLUP, Hendersoni segamudeli
võrrand fikseeritud ja juhuslike efektide samaaegseks
hindamiseks.
Loengumaterjal:
pt6_2010.pdf .
Praktikumi materjal ja ülesanded: jätkub
varemalt alustatud ülesande lahendamine, andmestik
GLM_naide.xls :
- konstrueeri täisastakuga mudelile vastavad plaanimaatriksid
X ja Z käsitledes isa
juhusliku faktorina ja ülejäänud faktoreid
fikseeritutena (ema vanus jäta üldse välja)
– pt 6.7;
- võta päritavus h2=0,2 ja leia viimase
mudeli parameetrite hinnangud Hendersoni segamudeli võrrandist
(valem 6.23); mida kujutavad enesest isade mõjude hinnangud?
-
Aeg, koht:
20.04.2011, 1215-15; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Üldine lineaarne mudel.
Loengumaterjal:
pt6_2010.pdf .
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
lõpus, andmestik iseseisva ülesande tarvis:
GLM_ise.xls .
-
Aeg, koht:
21.04.2011, 915-12; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Aretusväärtuste hindamine isa ja looma
mudelist.
Loengumaterjal:
pt71_2010.pdf .
Tarkvara:
SAMod_1c.xls
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
lõpus.
-
Aeg, koht:
27.04.2011, 1215-15; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Aretusväärtuste hindamine isa ja looma
mudelist.
Loengumaterjal:
pt71_2010.pdf .
Tarkvara:
SAMod_1c.xls
Iseseisvad ülesanded: ülesanded loengumaterjali
lõpus.
-
Aeg, koht:
28.04.2011, 915-12; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Erinevaid mudeleid loomade geneetilisel
hindamisel – emapoolse efektiga mudelid, longituudmudelid, mitmemõõtmelised
mudelid.
Loengumaterjal: Kaart, T. (2001). Ülevaade
geneetiliste parameetrite hindamisel kasutatavatest mudelitest.
Rmt.: Lokk, E. (toim.). Eesti Põllumajandusülikooli
Loomakasvatusinstituudi teadustöid 71, Tartu, 52 - 66.
Tarkvara: VCE (http://vce.tzv.fal.de/)
Andmed ja programmid: http://www.eau.ee/~ktanel/kool_ja_too/LKI_1_2608/vce/,
http://www.eau.ee/~ktanel/VL_0192/esthobu/
-
Aeg, koht:
04.05.2011, 1215-15; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Erinevaid mudeleid loomade geneetilisel
hindamisel.
Loengumaterjal: Kaart, T. (2001). Ülevaade
geneetiliste parameetrite hindamisel kasutatavatest mudelitest.
Rmt.: Lokk, E. (toim.). Eesti Põllumajandusülikooli
Loomakasvatusinstituudi teadustöid 71, Tartu, 52 - 66.
Tarkvara: VCE (http://vce.tzv.fal.de/)
Andmed ja programmid: http://www.eau.ee/~ktanel/kool_ja_too/LKI_1_2608/vce/,
http://www.eau.ee/~ktanel/VL_0192/esthobu/
-
Aeg, koht:
05.05.2011, 915-12; Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Erinevate loomaliikide puhul kasutatavad
aretusprogrammid.
Lingid: http://www.jkkeskus.ee/page.php?page=1091,
http://www.jkkeskus.ee/page.php?page=0116,
..., http://www-interbull.slu.se/national_ges_info2/framesida-ges.htm
-
Aeg, koht:
11.05.2011, 1215-15;
Kreutzwaldi 62, B-213.
Sisu: Erinevate loomaliikide puhul kasutatavad
aretusprogrammid. Ettekanded.
Lingid: http://www.jkkeskus.ee/page.php?page=1091,
http://www.jkkeskus.ee/page.php?page=0116,
..., http://www-interbull.slu.se/national_ges_info2/framesida-ges.htm
(vt "Linkide ja kirjanduse"
lehte).
-
Aeg:
18.05.2011.
Sisu: Koduste tööde esitamise tähtaeg
(kõik
kodused ülesanded ühe dokumendina: ylesanded_2011.pdf).
|
|